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| Registros recuperados : 24 | |
| 3. |  | BRAGA, M. F.; VIEIRA, M. L. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GIRALDI, I. O.; JUNQUEIRA, N. T. V. Mapeamento de QTL (quantitative trait loci) associados à resistência do maracujá-doce à bacteriose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 4. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; GARCIA, A. A. F.; COUTINHO, L. L. Base genética da correlação entre características de desempenho e de rendimento de carcaça no cromossomo 1 da galinha. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2011, Santos, SP. Anais... Santos: FACTA, 2011. Trabalhos de Pesquisa José Maria Lamas da Silva. 1 CD-ROM. Projeto: 02.09.07.006.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | FREITAS, E. G. de; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; PINTO, L. R.; XAVIER, M. A.; LANDELL, M. G. de A.; GARCIA, A. A. F. Modelos mistos para seleção de genótipos superiores e de futuros genitores de cana-de-açúcar. In: REUNIÃO ANUAL DA REGIÃO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA, 58.; SIMPÓSIO DE ESTATÍSTICA APLICADA À EXPERIMENTAÇÃO AGRONÔMICA, 15., 2013, Campina Grande. Modelagem estatística em áreas multidisciplinares: impactos causados pelas mudanças climáticas na Região Nordeste: anais. Campina Grande: Sociedade Internacional de Biometria, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; GARCIA, A.; COUTINHO, L. L. Multitrait composite interval mapping reveals pleiotropic QTL on chicken chromosome 1. In: CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 33., 2012, Cairns. Programme and abstract book... Cairns: ISAG, 2012. p.40.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | VIGNA, B. B. Z.; SANTOS, J. C.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; MOLLINARI, M.; CANCADO, L. J.; VALLE, C. B. do; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA; SOUZA, A. P. The Preliminary Genetic Linkage Map of hexaploid Brachiaria humidicola Based on Microsatellite Markers. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 42-45 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | ANONI, C. A.; MANCINI, M. C.; COSTA, E. A.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield related trait in a biparental cross of sugarcane. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 126.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | ROSÁRIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. QTLs associados a características de carcaça na galinha: mapeamento por intervalo vs mapeamento por intervalo composto. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 27., 2009, Porto Alegre. Anais [dos] trabalhos de pesquisa José Maria Lamas de Silva. [Campinas]: FACTA, 2009. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10. Publicado em CD-ROM (CD00156).| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 10. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; BOSCHIERO, C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. G. QTL's mapeados para características de desempenho na galinha através do mapeamento por intervalo composto com modelo misto. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais. São Carlos, SP: SBMA, 2008. 4 p. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 11. | | SILVA, F. E. de J.; GUIDO, L. N.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; ROSÁRIO, M. F. do. Regiões genômicas associadas a características de desempenho e carcaça no cromossomo 5 de linhagens brasileiras de galinha. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 3, p. 229-238, 2011. Projeto: 01.06.01.006.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | LIMA, B. M.; TEIXEIRA, J. E. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GRATTAPAGLIA, D.; VALLE, R. K. D.; CAMARGO, L. E. A. Identification of a novel QTL contributing to rust resistance in Eucalyptus. BMC Proceedings 2011, v. 5, Suppl 7, p. P32, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011 Arraial d?Ajuda, Bahia.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. S. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. Journal of Applied Genetics, Pozna, on line 28 nov. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 15. | | MORAIS, L. K. de; CURSI, D. E.; SANTOS, J. M. dos; SAMPAIO, M.; CAMARA, T. M. M.; SILVA, P. de A.; BARBOSA, G. V.; HOFFMANN, H. P; CHAPOLA, R. G.; FERNANDES JUNIOR, A. R.; GAZAFFI, R. Melhoramento genético da cana-de-açúcar. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. 40 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 200).| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 16. | | PEREIRA, G. S.; NUNES, E. S.; LAPERUTA, L. D. C.; BRAGA, M. F.; PENHA, H. A.; DINIZ, A. L.; MUNHOZ, C. F.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. Molecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species. Annals of Applied Biology, v. 162, n. 3, p. 347-361, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 17. | | COSTA, E. A.; ANONI, C. O.; MANCINI, M. C.; SANTOS, F. R. C.; MARCONI, T. G.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PERECIN, D.; MOLINARI, M.; XAVIER, M. A.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping including codominant SNP markers with ploidy level information in a sugarcane progeny. Euphytica, Dordrecht, v. 211, n. 1, p. 1-16, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 18. | | ANONI, C. O.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; MANCINI, M. C.; COSTA, E. A.; MOLLINARI, M.; MARCONI, T. G.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield components in a sugarcane commercial cross. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 55.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B. Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 34, n. 1, p. 88-102, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 20. | | PEREIRA, G. da S.; LAPERUTA, L. D. C.; NUNES, E. S.; CHAVARRIA, L.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; GERALDI, I. O.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. The sweet passion fruit (Passiflora alata) crop: genetic and phenotypic parameter estimates and QTL mapping for fruit traits. Tropical Plant Biology, v. 10, n. 1, p. 18-29, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| Registros recuperados : 24 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Milho e Sorgo. Para informações adicionais entre em contato com cnpms.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
09/09/2014 |
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Data da última atualização: |
23/05/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
GAZAFFI, R.; MARGARIDO, G. R. A.; PASTINA, M. M.; MOLLINARI, M.; GARCIA, A. A. F. |
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Afiliação: |
MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
A model for quantitative trait loci mapping. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 10, p. 791-801, 2014. |
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DOI: |
10.1007/s11295-013-0664-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Quantitative trait loci (QTL) mapping is an important approach for the study of the genetic architecture of quantitative traits. For perennial species, inbred lines cannot be obtained due to inbreed depression and a long juvenile period. Instead, linkage mapping can be performed by using a full-sib progeny. This creates a complex scenario because both markers and QTL alleles can have different segregation patterns as well as different linkage phases between them. We present a two-step method for QTL mapping using full-sib progeny based on composite interval mapping (i.e., interval mapping with cofactors), considering an integrated genetic map with markers with different segregation patterns and conditional probabilities obtained by a multipoint approach. The model is based on three orthogonal contrasts to estimate the additive effect (one in each parent) and dominance effect. These estimatives are obtained using the EM algorithm. In the first step, the genome is scanned to detect QTL. After, segregation pattern and linkage phases between QTL and markers are estimated. A simulated example is presented to validate the methodology. In general, the new model is more effective than existing approaches, because it can reveal QTL present in a full-sib progeny that segregates in any pattern present and can also identify dominance effects. Also, the inclusion of cofactors provided more statistical power for QTL mapping. |
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Palavras-Chave: |
Arquitetura genética. |
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Thesagro: |
Genética; Progênie. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02039naa a2200217 a 4500
001 1994580
005 2017-05-23
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
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100 1 $aGAZAFFI, R.
245 $aA model for quantitative trait loci mapping.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aQuantitative trait loci (QTL) mapping is an important approach for the study of the genetic architecture of quantitative traits. For perennial species, inbred lines cannot be obtained due to inbreed depression and a long juvenile period. Instead, linkage mapping can be performed by using a full-sib progeny. This creates a complex scenario because both markers and QTL alleles can have different segregation patterns as well as different linkage phases between them. We present a two-step method for QTL mapping using full-sib progeny based on composite interval mapping (i.e., interval mapping with cofactors), considering an integrated genetic map with markers with different segregation patterns and conditional probabilities obtained by a multipoint approach. The model is based on three orthogonal contrasts to estimate the additive effect (one in each parent) and dominance effect. These estimatives are obtained using the EM algorithm. In the first step, the genome is scanned to detect QTL. After, segregation pattern and linkage phases between QTL and markers are estimated. A simulated example is presented to validate the methodology. In general, the new model is more effective than existing approaches, because it can reveal QTL present in a full-sib progeny that segregates in any pattern present and can also identify dominance effects. Also, the inclusion of cofactors provided more statistical power for QTL mapping.
650 $aGenética
650 $aProgênie
653 $aArquitetura genética
700 1 $aMARGARIDO, G. R. A.
700 1 $aPASTINA, M. M.
700 1 $aMOLLINARI, M.
700 1 $aGARCIA, A. A. F.
773 $tTree Genetics & Genomes$gv. 10, p. 791-801, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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